מוסדות רבי מאיר כוללים בתוכם את האחריות על כל מתחם קבר הציון הקדוש של רבי מאיר בעל הנס, במהלך השנים שופץ ותוחזק הקבר והתווספו מוסדות חינוך ובניהם תלמודי תורה כוללים וגני ילדים. העמותות הקשורות למוסדות רבי מאיר כוללות רבי מאיר בעל הנס, ישיבת מאיר בת עין, עמותת קבר רבי מאיר בעל הנס זיע"א ועמותת יצחק אייזיק משכן קאליב.